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基因測序儀使用方法
發(fā)布時間:2024-09-04 10:59:12

準(zhǔn)備工作

設(shè)備校準(zhǔn):在開始測序之前,需要對基因測序儀進行校準(zhǔn),確保其性能符合標(biāo)準(zhǔn)。

樣本準(zhǔn)備:

DNA提取:從生物樣本(如血液、組織等)中提取DNA。

文庫構(gòu)建:將提取的DNA打斷成小片段,然后進行末端修復(fù)、加A尾、接頭連接等步驟,構(gòu)建成適合測序的文庫。

樣本質(zhì)量控制:對構(gòu)建好的文庫進行定量和質(zhì)控,確保文庫的質(zhì)量。

測序步驟

上機測序:

將合格的文庫樣本添加到測序反應(yīng)體系中。

將反應(yīng)體系加載到測序儀的樣本板(或芯片)上。

測序反應(yīng):

PCR擴增:對文庫樣本進行PCR擴增,以增加目標(biāo)區(qū)域的DNA量。

測序:測序儀會逐個讀取DNA片段的序列信息。

測序儀會按照預(yù)定的測序流程進行反應(yīng),通常包括以下步驟:

數(shù)據(jù)收集:

測序儀會將測序結(jié)果以圖像或數(shù)據(jù)流的形式輸出。

數(shù)據(jù)分析:

質(zhì)量控制:去除低質(zhì)量序列。

序列拼接:將測序得到的短讀段拼接成長序列。

比對:將拼接后的序列與參考基因組比對,確定變異位點。

變異注釋:對檢測到的變異進行功能注釋。

將測序數(shù)據(jù)導(dǎo)入生物信息學(xué)軟件進行分析,包括:

后續(xù)操作

結(jié)果解讀:根據(jù)數(shù)據(jù)分析結(jié)果,解讀測序數(shù)據(jù),得出生物學(xué)結(jié)論。

報告生成:將分析結(jié)果整理成報告,供臨床或研究使用。

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